Em reunião do Conselho Técnico da Série A, a Federação Bahiana de Futebol (FBF) definiu, junto com os dirigentes dos 10 times participantes do certame, a fórmula de disputa do Baianão 2021.
Em geral, o sistema permanece o mesmo. Nove rodadas na primeira fase, com jogos únicos. Os quatro melhores colocados se classificam para a semifinal, e os vencedores à final. As duas fases mata-mata serão disputadas em partidas de ida e volta.
As datas de início e término serão definidas quando houver a venda dos direitos de transmissão e das datas de torneios que acontecem paralelamente ao estadual. Apenas um clube será rebaixado em 2021, como foi em 2020.